Краткое HowTo, для регулярного использования.
1. Ставим саму утилиту cvsup , без GUI, ибо зачем на сервере GUI

serv# cd /usr/ports/net/cvsup-without-gui && make install clean

2. Создаем конфиг для обновления ( например cvsup.conf).

serv# vi /etc/cvsup.conf

Содержание файла:

*default host=cvsup6.ru.FreeBSD.org
*default base=/usr
*default prefix=/usr
*default release=cvs
*default tag=RELENG_7_2
*default delete use-rel-suffix

src-all
*default tag=.
ports-all

3. Запускаем само обновление:

serv# /usr/local/bin/cvsup -g -L 2 /etc/cvsup.conf

Собственно все.
Порты и исходники системы обновлены, можно пересобирать мир и ядро

Полезные ссылки:
Русские зеркала CVSup